El Túnel Subfluvial “Raúl Uranga – Carlos Sylvestre Begnis” es administrado por el Ente Interprovincial creado mediante el Tratado Interprovincial suscripto entre las provincias de Santa Fe y Entre Ríos. Su estructura de conducción garantiza la participación conjunta de ambos gobiernos provinciales en la definición de políticas y la gestión de esta infraestructura estratégica.